https://github.com/SuA0409/BioAI/blob/main/proj_diabetes/cnmf_t2d_treatment_preprocess.py
condition 구성
condition 이름 | 해석 | 질병 관련성 |
---|---|---|
T1D_NOD |
자가면역성 1형 당뇨 생쥐 (NOD 마우스) | T1D |
T1D_NOD_prediabetic |
NOD 마우스의 당뇨 전 단계 | T1D (전구 단계) |
T2D_db/db |
유전적 비만/인슐린 저항성 모델 생쥐 (db/db) | T2D |
T2D_db/db-treated_PairFeed |
VSG 대조군 (섭취량을 VSG군에 맞춤) | T2D (대조적 의미) |
T2D_db/db-treated_VSG |
위우회수술 (VSG) 처리된 T2D 생쥐 | T2D 치료 조건 |
T2D_mSTZ |
STZ로 당뇨 유도한 mSTZ 마우스 | T2D |
T2D_mSTZ-treated_estrogen |
에스트로겐 처리 | T2D + 호르몬 치료 |
T2D_mSTZ-treated_GLP-1_estrogen |
GLP-1 + 에스트로겐 복합 | T2D + 복합 치료 |
T2D_mSTZ-treated_GLP-1_estrogen+insulin |
GLP-1 + 에스트로겐 + 인슐린 | T2D + 복합 치료 |
T2D_mSTZ-treated_insulin |
인슐린 치료 | T2D + 치료 |
T2D_mSTZ-treated_GLP-1 |
GLP-1 치료 | T2D + 치료 |
RAM 문제로 downsampling 후 preprocess 진행
https://github.com/SuA0409/BioAI/blob/main/proj_diabetes/cnmf_t2d_treatment_downsampling.py