호재님 추가 발표

수미님 피드백

task: fragment remasking

액션 플랜

• 데이터 받아서 보기

  • SAFE-GPT(2024): datamol-io/safe-gpt , datamol-io/safe-drugs
  • SAFE tokenizer: https://github.com/datamol-io/safe

• 데이터로 score? 를 얻는 부분, PMO(Gao et al., 2022), 을 보기

  • https://github.com/wenhao-gao/mol_opt

• baseline 설계

  • architecture: MDLM 기반. https://s-sahoo.com/mdlm/
  • training, prediction, metric

• 문헌 조사 할 만한 주제

  • optimization or conditioned (guided) generation 전략
    • GenMol 에서의 전략을 고수할 필요는 없어 보인다.
  • discrete diffusion 연구에서 주로 목표하는 것들은 무엇인가?
    • e.g. discrete variable ↔ continuous embedding
    • MDLM 논문을 시작점으로 보면 좋을 듯