https://github.com/SuA0409/BioAI/blob/main/proj_diabetes/t1d_vs_t2d.py

좌측 fig1. T1D_NOD와 T2D_db/db UMAP 클러스터링 결과.

우측 fig2. UMAP 기반 clustering 결과

⇒ T1D에는 cluster 2와 3이, T2D에는 cluster 0, 1, 4가 형성되어있음을 확인할 수 있음.

좌측 fig3. cluster 별 T1D와 T2D 비율

우측 fig4. 조건(T1D/T2D) 별 cluster 비율

⇒ 두 조건(T1D/T2D) 간 세포 군집 구성의 차이가 뚜렷하게 존재함.

cluster_top5_markers.txt

fig5. 각 cluster 별 gene marker의 결과 (상세 내용은 첨부한 .txt 참고)

• T1D에 해당하는 cluster 2와 3의 gene marker의 결과
  • Arhgap20 : Rho GTPase 활성 조절 단백질로, 세포 신호전달 및 세포 형태, 운동성을 조절. 신경 돌연(outgrowth)에 대한 영향도 보고되었으나, T1D와 직접 연관된 연구는 아직 X
  • Fibin, Neil3, Itm2a 등 : 주로 발달, DNA 수리, 세포 분화 등과 관련된 유전자로, T1D 특이적으로 기능을 언급한 연구 부족
  • CIITA, C1QC, SLIT2, CSF2RB : 일부 면역 시스템 및 염증 경로에 간접적으로 관련될 가능성은 있으나, T1D와 명확히 연관된 인과 연구 부족
• T2D에 해당하는 cluster 0, 1, 4의 gene marker의 결과
  • FZD7 (Frizzled‑7) ****: Wnt 신호전달 경로의 수용체로, 일반적으로 대사 조절, 세포 분화, 지방 조직 형성에 관여. 일부 연구는 Wnt 경로의 불균형이 인슐린 저항성과 연관될 수 있음을 시사하지만, FZD7 자체가 T2D와 직접 연관된 논문은 아직 X
  • NOS1 (내피성 산화질소 합성효소) : 혈관 기능, 인슐린 분비 조절 및 말초 조직의 혈류 유지에 관여하며, 당뇨병성 혈관 합병증 관련 연구는 존재하나 T2D 유병 자체와의 인과 관계는 아직 X
  • Tex38, Spata45, Gm43597, Str ip2, Mecom, Pnoc, Rgs22, Plxnc1, Cdh17, Rslcan18 등 : 대부분 기능 예측은 가능하나, 명확한 T2D 관련 실험 연구나 임상적 연관 연구 X

t1d_vs_t2d_deg.csv

fig6. DEG 분석 결과.

상위 7개의 유전자 search 결과 (https://www.bgee.org/)

⇒ 당뇨 관련 기능 연구에 대한 자료 부족.